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Predição funcional para dados de sequenciamento de amplicons 16S
A predição funcional do metagenoma utilizando Picrust2 faz parte do rico conjunto de ferramentas e workflows do ERGO para estudos de sequenciamento de amplicons 16S.
Os projetos de sequenciamento de amplicons têm muitos benefícios, especialmente em relação a tempo de resposta e custo. Uma grande fraqueza é que, ao contrário do sequenciamento completo do metagenoma, a detecção direta das funções dos genes não é possível. No entanto, com o Workflow de Predição Funcional do ERGO usando Picrust2, o conteúdo funcional do conjunto pode ser inferido.
O workflow do ERGO prevê números EC, funções KEGG e vias funcionais. Diferenças gerais podem ser verificadas em um mapa de calor de categorias metabólicas, destacando diferenças entre grupos amostrais. Cada função pode ser explorada individualmente, revelando as principais diferenças entre amostras.
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